Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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