Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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