Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms