Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms