Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms