Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rab28Q99KL7 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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