Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lims1Q99JW4 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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