Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TardbpQ921F2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms