Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ncapd2Q8K2Z4 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ncapd2Q8K2Z4 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ncapd2Q8K2Z4 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ncapd2Q8K2Z4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ncapd2Q8K2Z4 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ncapd2Q8K2Z4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ncapd2Q8K2Z4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ncapd2Q8K2Z4 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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