Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Csnka2ipQ8CH19 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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