Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pramef8Q8CE24 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms