Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhsl1Q8CAF4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nhsl1Q8CAF4 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Katna1-202ENSMUST00000165806 1775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Katna1-201ENSMUST00000019929 1774 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 5031425E22Rik-203ENSMUST00000188328 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Lgals9-201ENSMUST00000073001 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nhsl1Q8CAF4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nhsl1Q8CAF4 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nhsl1Q8CAF4 1700095A13Rik-201ENSMUST00000185460 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nhsl1Q8CAF4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Klk11-201ENSMUST00000080211 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nhsl1Q8CAF4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nhsl1Q8CAF4 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Ighv2-5-201ENSMUST00000103449 347 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nhsl1Q8CAF4 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nhsl1Q8CAF4 Gm20945-201ENSMUST00000178122 1145 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm18471-201ENSMUST00000208272 452 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nhsl1Q8CAF4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms