Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atg16l1Q8C0J2 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Atg16l1Q8C0J2 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Atg16l1Q8C0J2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Atg16l1Q8C0J2 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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