Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Snx17Q8BVL3 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Snx17Q8BVL3 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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