Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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