Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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ChfrQ810L3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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ChfrQ810L3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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ChfrQ810L3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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ChfrQ810L3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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ChfrQ810L3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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ChfrQ810L3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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ChfrQ810L3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms