Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NischQ80TM9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NischQ80TM9 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms