Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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