Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Pkp4Q68FH0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Pkp4Q68FH0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Pkp4Q68FH0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Pkp4Q68FH0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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