Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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