Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms