Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms