Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Acsf3Q3URE1 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms