Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp30Q3UN04 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms