Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp19Q3UJD6 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp19Q3UJD6 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp19Q3UJD6 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp19Q3UJD6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Usp19Q3UJD6 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Usp19Q3UJD6 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Usp19Q3UJD6 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Usp19Q3UJD6 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Usp19Q3UJD6 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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