Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Edc4Q3UJB9 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Edc4Q3UJB9 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edc4Q3UJB9 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms