Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TraddQ3U0V2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms