Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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