Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vax1Q2NKI2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms