Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms