Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GscQ02591 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GscQ02591 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms