Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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Mesp1P97309 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mesp1P97309 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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Mesp1P97309 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms