Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms