Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pkn1P70268 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pkn1P70268 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pkn1P70268 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pkn1P70268 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pkn1P70268 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pkn1P70268 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms