Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms