Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Adam1a-201ENSMUST00000100757 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Lipe-204ENSMUST00000149349 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ccnd1-201ENSMUST00000093962 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ttc16-205ENSMUST00000161089 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Pa2g4-201ENSMUST00000026425 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Wfs1-202ENSMUST00000166339 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm26902-201ENSMUST00000181307 3100 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Rhof-204ENSMUST00000186469 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Atp9a-202ENSMUST00000109175 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Slc2a9-202ENSMUST00000067872 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Cd101-201ENSMUST00000147399 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Hdac7-203ENSMUST00000116408 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Fbxw11-202ENSMUST00000093205 3938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Tmem106a-202ENSMUST00000100403 2428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Echdc3-201ENSMUST00000042658 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Tmem19-204ENSMUST00000217887 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Fkbp5-202ENSMUST00000114792 3858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Zfp446-203ENSMUST00000108536 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Stx12-201ENSMUST00000030698 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Uqcc1-204ENSMUST00000109636 2633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Bhlhe40-201ENSMUST00000032194 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Trpv2-202ENSMUST00000102643 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Smoc1-201ENSMUST00000021564 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Txndc16-209ENSMUST00000153383 3691 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sem1P60897 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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