Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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