Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxc13P50207 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxc13P50207 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxc13P50207 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxc13P50207 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxc13P50207 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxc13P50207 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxc13P50207 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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