Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms