Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrprbP47758 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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SrprbP47758 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms