Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms