Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cd28P31041 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cd28P31041 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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