Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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