Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NapbP28663 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NapbP28663 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NapbP28663 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms