Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TP20293 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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