Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18528 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18528 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18528 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18528 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18528 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18528 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18528 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18528 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18528 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18528 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
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P18528 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
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P18528 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18528 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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