Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18524 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18524 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18524 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18524 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18524 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18524 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18524 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18524 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms