Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms