Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fv4P11370 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fv4P11370 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fv4P11370 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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