Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms